FastQCFastQC Report
Tue 7 May 2024
EGAF00007822548

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00007822548
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences120
Total Bases18.1 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TCTCAGGATAGGGATAAAGCAATAGCCCAGTGTGCAGGGCCAGTGACCAG10.8333333333333334No Hit
ATCTAATGGAGTTTTCCCATCTTCATCTCTCAGTTCTGGATTTGCACCAT10.8333333333333334No Hit
GGTCTTCTTGGTCTCAGGGTTGTGGGAGATAACGGTGGCATAGTTCCCTG10.8333333333333334No Hit
GGCATAGACCATTAAATTAAAGTATGCCATTACACAACCAGATTTAACCA10.8333333333333334No Hit
GGGACATGTCATTGATCTGCACATCATCGGTGCTCCACTTCCCAAAGAGC10.8333333333333334No Hit
GACATCACTTTCCAGACTGTCTCACTGTCTTGGGACCAGGCAGGGGAGGG10.8333333333333334No Hit
GAGTTCCTGCTGAAGAAGGCTTCGCTCCAGCCGCGGAGGGACCTGGGCTG10.8333333333333334No Hit
CTTATACACATCTGACGCTGCCGACGAGCGTAATGTTGTGGGGGGGTGGG10.8333333333333334No Hit
ACCCTGATCATCTATCAGGCGGAGGAAGCACCCGACACTGCTGCCTAATG10.8333333333333334No Hit
TTTTAAAAGTTGATGAATGAACTGGCAGACATATGAGGATACAAACACGT10.8333333333333334No Hit
GGGTGAGGAGATCAGACCATCTACCATCTTTCTTTCTAATCCCAGGAGCC10.8333333333333334No Hit
TTACCTCTTCACTCCAGCGTCATAGAGATCCCTAGCATCAAGGTCAATCA10.8333333333333334No Hit
GATTACCAGAGAAGGAGGTAATATTCACAATCTTCTGTAGATAATTAGCC10.8333333333333334No Hit
AGTGATATCCTAACGCAATTGAAACTACAGCTCATTAAACAACTTCTCCA10.8333333333333334No Hit
GAGGGTAGTGGTGGGATTCTTGAGGAAATCAGGTATGACAAGCAATCGTA10.8333333333333334No Hit
ATCAAGTGAGGCGCGTGTGCCACATCTTAGGTAACCGGCTTGTCCCCCGT10.8333333333333334No Hit
TTATAAATGCTGATTAGGTTTTAAGGTTCTCTTGCTGTTATAGATCAGCC10.8333333333333334No Hit
GTGGAAGCAGGTGGCTACAAAAAATGTAGAGCCGTACAAGCCGGAGGTAA10.8333333333333334No Hit
CCCCTGAGAGCAGATATATTTCAATTGTCCAGGCCAAAAGAGGGGCGAGG10.8333333333333334No Hit
GGGTACACATGAGGCCTTGGGGATGACTGCAAGTGCCAGAAAACGGGACG10.8333333333333334No Hit
CGCGGTCAGCAACAGCTCATCATCCGGCACAAACCGTAAGCAATCACCGT10.8333333333333334No Hit
ATAATATTCCTTGTCAATGATAATCTTCTCTTCCACGGTGTGGGACAGCA10.8333333333333334No Hit
GATATACACTAATCTATAAAATAAAGGATAATTCTCATAGCTGGGACATC10.8333333333333334No Hit
ACCGACTTGCAGTGGATGCTCTCCTCGCGCACAGCCCCGTTAAGGTATTC10.8333333333333334No Hit
CTATAATCCTTAGAAAAATTTACATAACGCATATTATAATTAGATTATAC10.8333333333333334No Hit
GGGACGCAGAGATTTTCTCTCCCAGCCTATGGAATAAGGAAGAGGTGAGG10.8333333333333334No Hit
CCAAAATGCAAGATCTTTACATCCCAGCCATCAAGAAAGAAATACAGATG10.8333333333333334No Hit
GCATACAACTGAAATTCAATAAAAATAATACAACGACTTACTCAAGATAT10.8333333333333334No Hit
GTCCGTGGCTGAATCATGGGGTCCCCCAGCCCCCCTCCCATGCCCCAATT10.8333333333333334No Hit
CTGCCCACTCCTCTGATGGGCGGAGTGCTTCTGCCTGAATCTGATGTCTC10.8333333333333334No Hit
TTAAAAGACAAACAAATAAATTAACAAGAACTTAAAGAAAACCTTAAATC10.8333333333333334No Hit
GAAAATATTGATTTTTAAATATTTAATTGATAAAAGCCAAATATCTAAAC10.8333333333333334No Hit
CTCAAGATGATTCTAAAATCATCTTTTGGAAAACCACAAAAGTTACACAT10.8333333333333334No Hit
GTCAATGGAAAGGGATATAGATAGAAGGATAGTTGGACTAAATGACTCAC10.8333333333333334No Hit
ATATAAAAATAAGTGCAATTTAATAAAATTAAAATAAGTCAAAACAACAA10.8333333333333334No Hit
ATAGTGAACTATACGGGTTTCATCCAAGGACTGGTATCATGTGGGCCTAA10.8333333333333334No Hit
TCATCTTCAGCCTCCTCTCAAACTTCAAGCTGACTATACATCAACAACAA10.8333333333333334No Hit
GAACTCAGAGTCCGCTACGACCATGCCGATGACCACCTAAACAGTCTAGC10.8333333333333334No Hit
CACTAAAGAAGATGCACACAAAGCACAGACACACTACGAAAGTGAGAAAA10.8333333333333334No Hit
CATCTGACGCTGCCGACGACCATTGTCTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGG10.8333333333333334No Hit
CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA10.8333333333333334No Hit
GGAGTAGGACTGCTGTGATTAGGACGGATCAGACGAAGAGGGGCGTTTGG10.8333333333333334No Hit
GGGAGCAGACACAGCAATGTCTGAACATTAAAAAAAAGCCATCACTGCTG10.8333333333333334No Hit
CCTAGTAGATGGGCACAGTGTTGGATACACCGTCACCGCAGTCCAAAACG10.8333333333333334No Hit
CTTGCAATGGCACATTTACCGAGATCCAAAATAAACTACCCTCAAATTCA10.8333333333333334No Hit
GTCTCAACGTGGACTCGACAGTACAGTCCAGCTCGATGGACCTGCCGACG10.8333333333333334No Hit
ACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGATGGCCCAGCTC10.8333333333333334No Hit
CCATGGTGGTGAAGACGCCAGTGGACTCCACGACGTACTCAGCGCCAGCA10.8333333333333334No Hit
TAATACATTCAATCAAATAATAATTGAGCAGCACACCACAAACAACTACG10.8333333333333334No Hit
AACACCCCAAAAAACACGGACACAAAGAACACTTCCATCGTGACCAAATT10.8333333333333334No Hit
GAGAACGTCACCTGCGTATCCGTTTTATTCAGATTGGACTTATCGAAGAT10.8333333333333334No Hit
TATTCAACCTGTTGTCAAAATTTTTAGAAAAATTTTCCCAGTTCCTTGTA10.8333333333333334No Hit
GCTTATGAAGATAAGATCATAAAATACCATGGACATAACATGCTAACTTG10.8333333333333334No Hit
AGCCTGGGGTGATGAGAGGTGGAGTCTCCCCTGGATGGTGACCGGACTTC10.8333333333333334No Hit
GCCCAGCCGGGACTCCTCCCCGCTGCACTCCCAGAATCTGTCCCACTCCC10.8333333333333334No Hit
CTTCTCCAAGTGGTTGATAACCATTTTGTTCATTCGATTTGGTCCATATG10.8333333333333334No Hit
ACAAAATAAACGATAAAAAATGTAGAACAACTACAATTACAACATCAAAT10.8333333333333334No Hit
GTATAAGGAGAAGATGGAAACGTCAACCGAGGATACAGCCAGGGAGTAGT10.8333333333333334No Hit
GCAAAGCACGGATCCTGCACAAAATCAAGCACCTGAAGTGTCAGCTGATG10.8333333333333334No Hit
GGTGTGCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTGGAGACAG10.8333333333333334No Hit
GGTTGATCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCTC10.8333333333333334No Hit
CTTATACACATCTGACGCTGCCGACGAGGGTAATGGTGGGGTGTTGTGGG10.8333333333333334No Hit
CTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGACGCTTAGCTGGTGGGGGGGTA10.8333333333333334No Hit
GGTTTGTTGTACAGATTATTTTATCAACCAGGAATTAAGCCCAGTATCCA10.8333333333333334No Hit
CAGAAATCATTCCCAAAACTCTATCAAAAATTAGAGACTTGGTCTTTTAC10.8333333333333334No Hit
CCTACCACTTTCCCAAACTTGGAAAATAGAGTTATGGAACAAAGTTAAGT10.8333333333333334No Hit
GTACAGAATAACTAGGATTATGTGTACAATGTCCTAAGAAGGAAGTTTGC10.8333333333333334No Hit
AACTCGCCTTGGTCTGGCAGAGACTGGGATCAACAGGACCAGCACCCATC10.8333333333333334No Hit
CACAAGCAGACCCAGGCCTGACCCGAATCGAGCTGCCTCATAGTGGGCGA10.8333333333333334No Hit
TCTTTATACGACTGTAACAGTGCTTTCAAAAGACATTTTGTGAAGGACAT10.8333333333333334No Hit
ATACACATCTGACGCTGCCGACGAGCGTAATGTTGTGTAGATATAGGTGG10.8333333333333334No Hit
CTACACAACTTCACAATTAACAACAGTTAGAAGTCCCGTTAGTAAAATGA10.8333333333333334No Hit
ACCCAAACCAGTAAACTGGCTCCACAGGTTTTGTAATTCCATCCAGGAAG10.8333333333333334No Hit
GGACAGCTGGGGGCCACAAGCTTCTTCCTACACATGCCTCAGGTCAGCCA10.8333333333333334No Hit
GTCTGGTCCGCAGCCTGGGGCAAAGCTTGTCTCTAAAGGGTTAATGAGGC10.8333333333333334No Hit
CTTAATAAGCTTCATACACCTTTATCATCGCAGTGTACAACCCCTCCTCA10.8333333333333334No Hit
AGTGGTCTGCGGTCGAGGAGGCGCAGAGGGCGATAGGACAGGGTCACAGC10.8333333333333334No Hit
CGTCAGATGTGTATAATATACAGATTGCGCAAACTGTCTATTATACACAT10.8333333333333334No Hit
GGGTATTACTATGAAGAAGATTATTACAAATGCATGGGCAGTGACCATAA10.8333333333333334No Hit
AAATCAATATTAAAAACAAATAAAGCATCCGTAGAACTTAAGTAACATGT10.8333333333333334No Hit
AGTTCTTTCCTACCCTGCCAGCGAGAAAGATAGACAGATGGGAAAGGCAG10.8333333333333334No Hit
GTTGTATATGGTTTCTAAATCGATTACAAAAACTTAAAATTCTATGTTTC10.8333333333333334No Hit
CCACACCATGGCATTGCGCAATCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCC10.8333333333333334No Hit
CTTATACACATCAGACGCTGCCGACGAGAGTAAATTGTTGTAGGTCTAGG10.8333333333333334No Hit
GGCTAAAACAAATTACGTTATTTAGTCTAAATCCAAAGCAAAATAGAATA10.8333333333333334No Hit
AAACATCCTGGGCAGCCAACATAGCAGCATATGGTGAGGATTCATCTCGG10.8333333333333334No Hit
CAGCAGCATACGATTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGGCAAA10.8333333333333334No Hit
TTATAACAACATGATCCCCACAGTCACTCAGTGCATGGTACACAGGTTTA10.8333333333333334No Hit
CAGACAAGACAAGGCCACATACAAAAGAAAGCGCATGGTAGTCTGATCCA10.8333333333333334No Hit
CCTAGAACTTGCGGTGTTCTTCCAGGCATAGGCCTGTGATCTTTCGGGTC10.8333333333333334No Hit
GGTAGGAGTAGCGTGGTAAGGGTGATGAGTGTGGGGAGGAATGGGGTGGG10.8333333333333334No Hit
CCCATTAACAATTCAAGAAATTTCATTGCTAATTTTAGTTTACCAAGAGT10.8333333333333334No Hit
ATAAAAGACACATTTGGTCAAATTTCAAGAAAGGTAAAGCCAGATACAAA10.8333333333333334No Hit
GCATACGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGGGCAAAAAATAA10.8333333333333334No Hit
ATACACATCTGACGCTGCCGACGACCATTGTCTTGTGGTGGTGTGGGTGG10.8333333333333334No Hit
ATGTTTATAATTGATAAAAAAAACAAATAATCGGCCAACACCTGGAAAAT10.8333333333333334No Hit
CATTTGGGAGGTTATAATTTGCAACTATGTTTATTCAGCTACCTCCAATC10.8333333333333334No Hit
TCCGTGTCCTCCTCCTCCAGCTCACTAACCATCAGTTCAAACTCATCATC10.8333333333333334No Hit
GTAGTATAGTGATGACATCATATAGCAATGTCAGAGATAGGATAATAATG10.8333333333333334No Hit
CAAAAAGTGAATAATAAGTAACCAGCGCTAGAGTGCCATCTAGATAACTA10.8333333333333334No Hit
ACTAGTAAATGAGTGAATTAAGACAACATCAATTATACCTCAATTTTTAA10.8333333333333334No Hit
GGCAGGCACCAGGATCTGCTCGTGCCACTGCGCCCGCCGCCAGGCCTTGA10.8333333333333334No Hit
GCTATAATCTAGCCAGTTACTCATCTAGTGAAACTAAGGAATCAACATAA10.8333333333333334No Hit
ATAAAGAACACATCCCAATCCACCAAATCCAATCAAATAAAAAAAAAAAA10.8333333333333334No Hit
GCCTAATTCTAAAAATTCAATGATTTCACTCAATAGCATCTCTAGTTTCA10.8333333333333334No Hit
GCAATAGTCCAATGGCAAGGACAGCAATCCCGGCAAGCCAGAAGATGAAG10.8333333333333334No Hit
CCTGAAGATTTACAGTTCAGCTTTGCTTACATAACCATTTAAAAAATACT10.8333333333333334No Hit
GTCTTACTACTTTGACCGCGATGATGTGGCTTTGAAGAACTTTGCCAAAT10.8333333333333334No Hit
CTTACCCTACTAGTCACCCAAGACACACCAATCAAAGAAAAAAAACATAA10.8333333333333334No Hit
GGTTAGGTCTACGGAGGCTCCAGGGTGGGAGTAGTTCCCTGCTAAGGGAG10.8333333333333334No Hit
GACAAGTTCTCTATTATGCCAATGATTGTCTCAGACACACCTTCCACCAC10.8333333333333334No Hit
AATAAATGTGTTTCAAATATTTTATTTTTTTTTATTCAAAAAATTTCCAC10.8333333333333334No Hit
GCACATTGCCAATGTTGAGCTGGGCCTTCTTGCCGCAATACACAAACTGG10.8333333333333334No Hit
CAGCCATTCCTATCTCAAGCAGTATCTAATACCCCTCTTAAGCTGCCGAC10.8333333333333334No Hit
GGTCCACCGGCCCCTACATTGCAGATGAGGCTCCCAATGTTGACGTTGGC10.8333333333333334No Hit
GGGGAAACTGGGGCCGTTTTATTGACGATGGCAATGTACAAGACTCCACA10.8333333333333334No Hit
TGATCCGTAAAATACGAAAAGACCTATCACAAATAAGAGGCACAAACTCA10.8333333333333334No Hit
GGGGGCGATTTTTTTGTTGTTTGTTTTTTTTTTTTTTTCGACTAGGAGTG10.8333333333333334No Hit
GAATACAATAACACAAACATCATGCCAATCCAGCCATTCAAACTTAAATT10.8333333333333334No Hit
GTCCACCTAAAACAACTGTGAACCACTGCAATTATTCTTATAGACAAGTT10.8333333333333334No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.12.1)