FastQCFastQC Report
Sun 21 May 2023
EGAF00007837653

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00007837653
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences43234
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length250
%GC52

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[WARN]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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TCATGCCTTGTGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTCCCGAGCGTTA440.101771753712356No Hit
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TCATGCCTTGTGTGTCAGCAGCCGCGGTAACACGTAAGGGGCGAGCGTTG440.101771753712356No Hit

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