FastQCFastQC Report
Sun 11 Jun 2023
EGAF00008066348

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008066348
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences192
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length105
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GACCAAACCATGAAACCAACATAAACATTATTGCCCGGCGTACGGGGAAG3920.3125No Hit
GGGGAGCACATTGTAGCATTGTGCCAATTCATCCATTAACTTCTCAGTAA2010.416666666666668No Hit
ATTTTTCGACTCATCAGAAATATCCGAAAGTGTTAACTTCTGCGTCATGG189.375No Hit
AATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGACCACTCGCGATTCAATC178.854166666666668No Hit
ATGGATGAATTGGCACAATGCTACAATGTGCTCCCCCAACTTGATATTAA178.854166666666668No Hit
CATTTTAGTAAGCTCTTTTTGATTCTCAAATCCGGCGTCAACCATACCAG136.770833333333333No Hit
AGGACGGTTGTCAGCGTCATAAGAGGTTTTACCTCCAAATGAAGAAATAA136.770833333333333No Hit
CTGAACAATCCGTACGTTTCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCATT126.25No Hit
TAACGCCGAAGCGGTAAAAATTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCA105.208333333333334No Hit
GACCAAACCATGAAACCAACATAATCATTATTGCCCGGCGTACGGGGAAG21.0416666666666665No Hit
GTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATAATACAAGCCATTTATTGTCTCACC10.5208333333333333No Hit
TGTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATATTAAATCCACCACGAAAACCCTC10.5208333333333333No Hit
TTGCCAGCCTTCTTCCCATTTGCCTTCCTCCCCCCTTCTCTCCCCTTTTT10.5208333333333333No Hit
TGTGCCGGCACGATCCAATCTCGCATACCTCAAGCCGGCGAGAACATGGT10.5208333333333333No Hit
GTGCCAGCACGATCCAATCTCGCACATCACCAGCGCTGGGACGCGACTGC10.5208333333333333No Hit
TGTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATAAATAATGACTGCGAGAACATGGT10.5208333333333333No Hit
TGTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATAGATGCAATACTGTTGCTCCAAAC10.5208333333333333No Hit
TTTACTTTTTCACCACAGGCCTTAAAGTGCTCCAAATGTCCTCTTACAGA10.5208333333333333No Hit
CATTTTAGTAAGCTCTTTTTGATTCTCAAATCCGGCGTCAACCATACCCG10.5208333333333333No Hit
TGCCAGCACGATCCAATCTCGCATACTTTGAAAATCCAGCTCCTGGGACT10.5208333333333333No Hit
ATTTTTCGACTCATCAGAAATATCCGCAAGTGTTAACTTCTGCTTCATGT10.5208333333333333No Hit
GTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATAGATCCAGTAGTGGAGAATGTCAGT10.5208333333333333No Hit
TGTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATAAAACCTGCAACCACGAAAACCCT10.5208333333333333No Hit
ATTTTTCGACTCATCAGAAATATCTGAAAGTGTTAACTTCTGCGTCATGG10.5208333333333333No Hit
TGCCAGCACGATCCAATCTCGCATATTATGATAACACGGAAGGGCTTGTT10.5208333333333333No Hit
GTGCCAGCACGATCCGATCTCGCATACCACAAAAGCAAACAGTGCACGAC10.5208333333333333No Hit
TCCCGCACAAAGAGCTTGTCATTCACGATGCACTTATCTCGTATGCCGTC10.5208333333333333No Hit
TGCCAGCACGATCCAATCTCGCATAAATTATGGTGGTGGGCAGCCCAGAC10.5208333333333333No Hit
TTATACGAAGATATTTCCTTTTCTGCCTTTGGCCTCAAAGCGCTTGAAAT10.5208333333333333No Hit
ATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGAAGGATGGTGTTAATGCCACTCCT10.5208333333333333No Hit
GTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATACCTCCTAAACTGATCTGGCCAAGG10.5208333333333333No Hit
CATTTTAGTAAGCTCTTTTTGATTTTCAAATCCGGCGTCAACCATACCAG10.5208333333333333No Hit
TGCCAGCACTATCCAATCTCGCATATATTTACAGACTGTGGGGACTGGGA10.5208333333333333No Hit
TGTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATACGTGGTACCGGCGAGAACATTGT10.5208333333333333No Hit
GTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATAGGTGTTGCCTCGCAGCCGCCGCTG10.5208333333333333No Hit
ATGGATGAATTGGCACAATGCTACTATGTGCTCCCCCAACTTGATATTAA10.5208333333333333No Hit
TGTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATATGAAGACCCGAGAGAAAAAGGTG10.5208333333333333No Hit
TGTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATACTACTAATCGGCGAGAACATGGT10.5208333333333333No Hit
GACCAAACCATGAAACCAACATAAACATTATTGCCCGGCGTCCGGGGCAG10.5208333333333333No Hit
CATTTTAGTAAGCTCTTTTTGATTCTCAATTCCTTCTTCCACCTTACCAT10.5208333333333333No Hit
TGTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATATGTTGTCGCCTGGGCTCCTTCCC10.5208333333333333No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)