FastQCFastQC Report
Sun 11 Jun 2023
EGAF00008066445

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008066445
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length105
%GC49

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TGTGCCAGCACGATCCAAGCTCGCATATAAAGTCTGAAGTTCGAAGAGCC14.166666666666666No Hit
CAGCACGATCCAATCTCGCATAGGATTTGATCTGTGCCGTGCCAGAGTGC14.166666666666666No Hit
CCAGCACGATCCAATCTCGCATACGAGAACAACTGTAAGCAGGTCTAAAA14.166666666666666No Hit
CCAGCACGATCCAATCTCGCATACATACATTCAGAGTGTGGAATTCTGTG14.166666666666666No Hit
TGCCAGCACGATCCAATCTCGCATAGCTGGTACAGCCTTTCCCTTCCTCT14.166666666666666No Hit
TGTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATAGTTGCACCACGCTAAGCCATAGT14.166666666666666No Hit
TGTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATACGAACTTGGTTTAGGAGCCAGGA14.166666666666666No Hit
CGCACGATCCAATCTCGCATACGTCAATCAGTGTTTCTGTCATCCAAATA14.166666666666666No Hit
TGCCAGCACGATCCAATCTCGCATACATTCTGCCGGCGAGAACATGGTGC14.166666666666666No Hit
TGTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATAAATTGACCACCAAGTACATGGAT14.166666666666666No Hit
TGCCAGCACGATCCAATCTCGCATAGAATGATTAAGATTCATCACCATTT14.166666666666666No Hit
TGCCAGCACGATCCAATCTCGCATATGAAGTTCGGAGGAGTTGCAAACAG14.166666666666666No Hit
TGCCAGCACGATCCAATCTCGCATATCTCTACGCGGCGAGAACATGGTGC14.166666666666666No Hit
TGTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATAGCATATTATGAGTGCTTCGGCTT14.166666666666666No Hit
TGTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATAACACAACTACCAAACGCTACATG14.166666666666666No Hit
TGCCAGCACTATCCAATCTCGCATATGACATATCAGGTCGCTGGGTGACT14.166666666666666No Hit
TGCCAGCACGATCCAATCTCGCATACAAACAGACGGCGAGAACATGGTGC14.166666666666666No Hit
TGCCAGCACGATCCAATCTCGCATATTAATAGGCGGCGAGAACATGGTGC14.166666666666666No Hit
TGTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATACAATATAGCACATGTAGACATTG14.166666666666666No Hit
TGTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATAGCTTTAGCTTGGATGGTGCCTGT14.166666666666666No Hit
TGTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATAGTTGATCGCCTTGGTGGCCAGGG14.166666666666666No Hit
TGCCAGCACGATCCAATCTCGCATAACAGGTAAGGCATGAAAGCAGAGGC14.166666666666666No Hit
TGTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATACAAAAATACGTTCTTTGGATAAC14.166666666666666No Hit
TGTGCCAGCACGATCCAATCTCGCATATGTGGTTGCATTCTTGGGATTAC14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)