FastQCFastQC Report
Wed 28 Jun 2023
EGAF00008092890

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008092890
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences18609
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length281
%GC53

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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