FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008130302

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008130302
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences3840
Total Bases554.9 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length143-145
%GC56

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CCATTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATC215556.119791666666664No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAACCCTGTGATGATTGATGCTCACAGAGACCAA42611.09375No Hit
AGATCATGTACGTCGGGGACGTCCGCAGCGTCACACAGAAGCATATCCAG3398.828125No Hit
AGATCATGTACGTCGGGGAGGATAAAGGCAACGTTCACAGAGACCAAGTC962.5No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAACCCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATC651.6927083333333333No Hit
CATTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATCG421.09375No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATCG350.9114583333333334No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATCG300.78125No Hit
CCTTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATCG250.6510416666666667No Hit
AGATCATGTACGTCGGGAGGATAAAGGCAACGTTCACAGAGACCAAGTCT160.4166666666666667No Hit
CCATTAGTGAGCTGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATCG130.3385416666666667No Hit
CCATTAGTAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATCG130.3385416666666667No Hit
CCATTATGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATCG110.2864583333333333No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAACCCTTGATGATTGATGCTCACAGAGACCAAG110.2864583333333333No Hit
CCATTAGTGGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATCG100.26041666666666663No Hit
CCTTTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATC80.20833333333333334No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCACACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATC80.20833333333333334No Hit
CCATTAGTGAGCGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATCG80.20833333333333334No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGTTATACCTCGAGAAATC70.18229166666666666No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATATCTCGAGAAATC70.18229166666666666No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAAACCTGTGATGATTGATGCTCACAGAGACCAA70.18229166666666666No Hit
CCATAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATCG70.18229166666666666No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCAGGCTATACCTCGAGAAATC70.18229166666666666No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCATACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATC70.18229166666666666No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCAACCCTGTGATGATTGATGCTCACAGAGACCAAG70.18229166666666666No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATGCCTCGAGAAATC70.18229166666666666No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAGTC70.18229166666666666No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAACCCTGTGATATTGATGCTCACAGAGACCAAG60.15625No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCAAACCCTGTGATGATTGATGCTCACAGAGACCAA60.15625No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAATCCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATC60.15625No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCTAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATC50.13020833333333331No Hit
TCATTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATC50.13020833333333331No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTACTGGCTATACCTCGAGAAATC50.13020833333333331No Hit
CCATTGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATCG50.13020833333333331No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGGGAAATC50.13020833333333331No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGGTGCTGGCTATACCTCGAGAAATC50.13020833333333331No Hit
AGATCATGTAGTCGGGGACGTCCGCAGCGTCACACAGAAGCATATCCAGG50.13020833333333331No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAAACCAGGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATC40.10416666666666667No Hit
AGATCATGTACGTCGGGGACGTCCGCAGCGTCACACAGAAACATATCCAG40.10416666666666667No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAACCCTGTATGATTGATGCTCACAGAGACCAAG40.10416666666666667No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGATATC40.10416666666666667No Hit
CCATTAGTGACTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATCG40.10416666666666667No Hit
AGATCATGTACGTCGGGGGGATAAAGGCAACGTTCACAGAGACCAAGTCT40.10416666666666667No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAACC40.10416666666666667No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGCTGCTGGCTATACCTCGAGAAATC40.10416666666666667No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCCCGAGAAATC40.10416666666666667No Hit
CAATTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAAATC40.10416666666666667No Hit
CATTAGTGAGCTGGCCAACCCTGTGATGATTGATGCTCACAGAGACCAAG40.10416666666666667No Hit
CCATTAGTGAGCTGGCCAAACCAAGGTTGCTGGCTATACCTCGAGAGATC40.10416666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.12.1)