FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008147546

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008147546
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences684
Total Bases99.1 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length143-145
%GC55

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGTGTTTGGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCA43463.450292397660824No Hit
CTCCAAGTAACGGTGCTGTCTGCTGGCTGGTGCAGGGCTCCTGGTGCTGA324.678362573099415No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGTGCTGTCTCTCTTTGATGGTGCTGTCTCTC243.508771929824561No Hit
GCAAAAGTTCTCAGGGATGTCCTATTGCTAAGTGGGAGAACTTGCGCCTG182.631578947368421No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGAATCGCTACAGGGCTCCTGGTGCTGAAGGA152.1929824561403506No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGTGCCTCCTTCTCTTTTGGTTGTTACGCAGA131.9005847953216373No Hit
CTCCAAGTAACGGTGCGGCCACTGATAGGATTACGCAGACCAAGTCTCTG131.9005847953216373No Hit
CTCCAAGTAACGGTGCTGCCACTGATAGGATTACGCAGACCAAGTCTCTG91.3157894736842104No Hit
GGTGTTTGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCAG71.023391812865497No Hit
GTGTTTGGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCAG50.7309941520467835No Hit
GGTGTTTGGGATGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCAG50.7309941520467835No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGTGCTGTCTCTCTTTGATGGTGCCTCCTTCT50.7309941520467835No Hit
GGTGTTGGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCAG40.5847953216374269No Hit
GGTGTTTGGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGTA40.5847953216374269No Hit
GGTGTTTGGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCACAGAAGCAGCA30.43859649122807015No Hit
GCAAAAGTTCTCAGGGATGTCGGTGCCTCCTTCTCTTTTGGTTGTTACGC30.43859649122807015No Hit
GGTTTTGGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCAG20.29239766081871343No Hit
GGTGTTTGGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCGGAAGCAGCA20.29239766081871343No Hit
GTGCCTCCTTCTCTTTTGGTTGTTACGCAGACCAAGTCTCTGCTACCGTA20.29239766081871343No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGTCATCCCCAAGCAGCTTAGTGAGGACCACC20.29239766081871343No Hit
GGGTGTTTGGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGC20.29239766081871343No Hit
GCAAAAGTTCTCAGGGATGTCCTGTCCAATGCCAAAATTCTTAGGCCTTT20.29239766081871343No Hit
CTCCAAGTAACGGTGCTGTCTCTCTTTGCGGCCACTGATAGGATTACGCA20.29239766081871343No Hit
CTCCAAGTAACGGTGCTGTCTCTCTTCACCCTTTGCCCTTACGCAGACCA20.29239766081871343No Hit
GGTGTTTGGGATGGATTGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCA20.29239766081871343No Hit
GGTGTTTGGGATGGAATGGTGGTCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCA20.29239766081871343No Hit
GGTGTTTGGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGAGGTTCGCAGAAGCAGCA10.14619883040935672No Hit
CAAAAGTTCTCAGGGATGTCCTATTGCTAAGTGGGAGAACTTGCGCCTGT10.14619883040935672No Hit
GCAAAAGTTCTCAGGGATGTCCCCAGTTGTATGATTGATGCTTACGCAGA10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGAGAGGGTAAAGGGCTCCTGGTGCTGAAGGA10.14619883040935672No Hit
GGTGTTTGGGATGGAAGGGTGAGCCACGCGGGGGGTTCGAGGAGGCGGAG10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGAGATGCCTCAGGTATAGTGTGGATGCAGGA10.14619883040935672No Hit
GGTGTTTGGGATGGAATAGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCA10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGACACGGAAATGTTGAATACTCATCTTGTGC10.14619883040935672No Hit
GGTTTTGGGATGGAATGGTGTTCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCAG10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGTGCTGTCTCTCATTGATGGTGCAGTCAAGC10.14619883040935672No Hit
CTCCAAGTAACGGTGCGAGGGTAAAGGGCTCCTGGTGCTGAAGGACTTCG10.14619883040935672No Hit
CTCCAAGTAACGGTGCTGTCTCTCTTCACCTTTGCCCTTACGCAGACCAA10.14619883040935672No Hit
GGTGTTTGGGATGGATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCAG10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGTAATCGCTACAGGGCTCCTGGTGCTGAAGGA10.14619883040935672No Hit
CTCCAAGTAACGGAGCTGTCTGCTGGCTGGTGCAGGGCTCCTGGTGCTGA10.14619883040935672No Hit
GCAAAAGTTCTCAGGGATGTCCTCTGCGTTGATACCACTGCTTCCCATGT10.14619883040935672Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (96% over 25bp)
GCAAAAGTTCTCAGGGATGTCCTATTGCTAAGTGAGAGAACTTGCGCCTG10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGTGCCTCTTCTCTTTTGGTTGTTACGCAGAC10.14619883040935672No Hit
GCAAAAGTTCTCAGGGATGTACTCTGCGTTGATACCACTGCCTCCTTCTC10.14619883040935672Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (96% over 25bp)
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGTGCTGTCTCTCTTTGATGGTGACTCCATCT10.14619883040935672No Hit
GCAAAAGTTCTCAGGGAGTCCTATTGCTAAGTGGGAGAACTTGCGCCTGT10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGGGGGCTGTCTCTGTTTGAGTGGCTCCTGTA10.14619883040935672No Hit
GCAAAAGTTCTCAGGATGTCCTATTGCTAAGTGGGAGAACTTGCGCCTGT10.14619883040935672No Hit
CTCAAGTAACGGTGCGGCCACTGATAGGATTACGCAGACCAAGTCTCTGC10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGATGCCCCTTCTCTTTGGTTGTTACGCAGACC10.14619883040935672No Hit
GGTGCTTGGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCA10.14619883040935672No Hit
GCAAAAGTTCTCAGGGATGTCGCGTGAGTTCAGGCTTTTTCATGGTTTAG10.14619883040935672No Hit
GGTGTTTGGGTGGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCAG10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGATAGGTATGAGTTAGTGTACGTTAAGGTTT10.14619883040935672No Hit
GGTGTTTGGGATGGAATGGTGATCCACGCGGGTGGTTCGCAGAAGCAGCA10.14619883040935672No Hit
GGTGTGGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCAGT10.14619883040935672No Hit
GGTGTTTGGGATGGAGTGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCA10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTGAGAGGGTAAAGGGCTCCTGGTGCTGAAGGACTTCG10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGGTGCTGTCTCTCTTTGATGGGTGCTGTCTC10.14619883040935672No Hit
GCAAAAGTTCTTCAGGGATGTCTGAGAGCTGAAAGATTTGGGTAGGAGTT10.14619883040935672No Hit
GGTGTTTGGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCT10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGTGCTGTCTCTCTTTGATGGTGCTGACTCTC10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGAGGGTGCTTTCTCACGTTGAGGGAGGTTGG10.14619883040935672No Hit
GCAAAGTTCTCAGGGATGTCCTATTGCTAAGTGGGAGAACTTGCGCCTGT10.14619883040935672No Hit
GGTGTTTGGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGTGGCTCGCAGAAGCAGCA10.14619883040935672No Hit
CTCCAAGTAACGGTGCTGTCACTGATAGGATTACGCAGACCAAGTCTCTG10.14619883040935672No Hit
GGGTTTGGGATGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCAGT10.14619883040935672No Hit
GGTGTTTGGGATGGAATGTTGTACCCGGAGGGGGGTGGCATGAGCAGGAG10.14619883040935672No Hit
GCAAAAGTTCTTCAGGGATGTCCTATTGCTAAGTGGGAGAACTTGCGCCT10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGTGCTGTCTCTCTTTGACGGTGCTGTCTCTC10.14619883040935672No Hit
GGTGTTTGGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCGGCA10.14619883040935672No Hit
GGTGTTTGGGATGGAATGGTGATCCACGAAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCA10.14619883040935672No Hit
GGTGTTTGGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTCCGCAGAAGCAGCA10.14619883040935672No Hit
GCAAAAGTTCTCAGGGATGTCGCGGTGAGTTCAGGCTTTTTCATGGTTTA10.14619883040935672No Hit
GGTGTTTCGGATGGAATGGTGATCCACGCAGCTGGTTCGCACAAGCAGCA10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGTGCTGTCTCTCTTTGATGGTGATGTCTCTC10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGATCCGCCTGTGCACATTCAGGTTGGAGCCT10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTTTGATGGAATCGCTACAGGGCTCCTGGTGCTGAAGGACT10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTGATGGAATCGCTACAGGGCTCCTGGTGCTGAAGGACT10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGAGGTGCTGTCTCTCTTTGATGGAGGTGCCT10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGAGGTGCTGTCTCTCTTTGATGGAGGTGCTG10.14619883040935672No Hit
GGTGTTTGGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTTGCAGAAGCAGCA10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGAGGGGTGCCTCCTTCTCTTTTGGTTGTTAC10.14619883040935672No Hit
GGTGTTTGGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGCGGTTCGCAGAAGCAGCA10.14619883040935672No Hit
GATGTTTGGGATGGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCA10.14619883040935672No Hit
GGTGTTTGGGATTGAATGGTGATCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCA10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTTGGTTGTTACGCAGACCAAGTCTCTGCTACCGTAG10.14619883040935672No Hit
CTCCAAGTAACGGTGCGCCACTGATAGGATTACGCAGACCAAGTCTCTGC10.14619883040935672No Hit
GTGCTGTCTCTCTTTGATGGTGCCTCCTTCTTTTTGGTTGTTACGCAGAC10.14619883040935672No Hit
GCAAAAGTTCTCAGGGATGTCCATGGTCAGCCAACCCTGGATGATTGATG10.14619883040935672No Hit
GGTGTTTGGGATGGAATGGTGACCCACGCAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCA10.14619883040935672No Hit
GCAAAAGTTCTCAGGGATGTCCAGGCTTTTTCATGGTTTAGTTCCTCACA10.14619883040935672No Hit
GGTGTTTGGGATGGAATGGTGATCCACACAGGTGGTTCGCAGAAGCAGCA10.14619883040935672No Hit
GCAAAAGTTCAGGGATGTCCTATTGCTAAGTGGGAGAACTTGCGCCTGTC10.14619883040935672No Hit
GCAAAAGTTCTCAGGGATGTGTCTGGAGTCTTGGAAGCTTGACTACCCTA10.14619883040935672No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph