FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008150331

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008150331
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences7749
Total Bases1.1 Mbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length141-145
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT416653.76177571299523No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG159220.544586398244935No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTGTGTGAAGACCAAGTCTC5807.484836753129436No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC1181.52277713253323No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTGTGTGAAGACCAAGTCTC1051.3550135501355014No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG580.7484836753129437No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG460.5936249838688863No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGCAGCTCTGAACGGTATTTGTGTGAAGACCAA380.49038585623951475No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC290.37424183765647184No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTGTGTGAAGACCAAGTCTC270.34843205574912894No Hit
GTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC250.32262227384178604No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC240.30971738288811457No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCGT200.2580978190734288No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC200.2580978190734288No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGACTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT190.24519292811975738No Hit
ACTTAAAAACAAGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC180.23228803716608595No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTTGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG150.19357336430507163No Hit
ATTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC140.18066847335140018No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCC140.18066847335140018No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGTTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT130.16776358239772873No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCCAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT120.15485869144405728No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCCGCCT120.15485869144405728No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGCTTCTGCCT110.14195380049038586No Hit
CTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC100.1290489095367144No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTACTACAGTTTCTGCCT100.1290489095367144No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTACCT100.1290489095367144No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCCACAGTTTCTGCCT100.1290489095367144No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGTTACAGTTTCTGCCT90.11614401858304298No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTGTGTGAAGACCAAGTCTCT90.11614401858304298No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAACGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT90.11614401858304298No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGTCT90.11614401858304298No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTCCATTCTAGTGCCGTGTGAAGACCAAGTC80.10323912762937153No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTCTCTGCCT80.10323912762937153No Hit
ACTTAAAAACAAGGCGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC80.10323912762937153No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAGTGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT80.10323912762937153No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTGTGTGAAGACCAAGTCTCT80.10323912762937153No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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