FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008151333

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008151333
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences977
Total Bases141.6 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length144-145
%GC46

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT50151.27942681678608No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC16516.888433981576252No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG838.49539406345957No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC565.731832139201638No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC212.1494370522006143No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG171.7400204708290685No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC141.4329580348004094No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC141.4329580348004094No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTCGTGAGACCAAGTCTCT50.511770726714432No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT40.4094165813715456No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC30.3070624360286591No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT30.3070624360286591No Hit
ACTTAAAAACAAGGCATGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC30.3070624360286591No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC30.3070624360286591No Hit
CTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT20.2047082906857728No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT20.2047082906857728No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC20.2047082906857728No Hit
ACTTAAAACAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT20.2047082906857728No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT20.2047082906857728No Hit
ATTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC20.2047082906857728No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGCGCTACAGTTTCTGCCT20.2047082906857728No Hit
ACTTAAAAACCAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCC20.2047082906857728No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT20.2047082906857728No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG20.2047082906857728No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGATATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTAATGCCTAATGGTGCTACGGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACAAACTCTC10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTCTTCGTGAGACCAAGTCTC10.1023541453428864No Hit
ACCTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCACTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGCTACCCCAAGCTGGCAGC10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCCACAGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCATGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCC10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCGAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGATACAGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCAGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAAAGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAAAAGGGTAAAG10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTACTACAGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAAAAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGATAATGACTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGACAGACCAAGTCAC10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAATGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCCAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGAGCTACAGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATATTTCGTGAGACCAAGTCTC10.1023541453428864No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTATGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAGC10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTATC10.1023541453428864No Hit
TGTGTGTGTGTTTTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGCTA10.1023541453428864No Hit
TATGTGTGTGTTTCTGTGGGCCAGTTTGCTTGGCGTAGAGGTCCATTCTA10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAACAAGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGATAATGCATAATGGTGCTACAGTTTCTGCAT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.1023541453428864No Hit
CTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGACTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCCGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGTCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGTTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTACTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCCAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACAGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCATAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
TGTGTGTGTGTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.1023541453428864No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAGGGGTAAAG10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCC10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAACAAGGCGGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGTCTC10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGATATCTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGATGGGTATTTTTCGTGAGGCCACGTCAG10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAGC10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCTT10.1023541453428864No Hit
TGTGTGTGTGTTTCCATTGCGGTGCAGAAAACCACATCTCACATAAATGC10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTTTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAGTGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAAAGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTAGTGAGACCAAGTCTC10.1023541453428864No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTCCAGTTTGCTTGGCGAAGAGGTCCATTCT10.1023541453428864No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAA10.1023541453428864No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.1023541453428864No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACGGTTTCTGCCTC10.1023541453428864No Hit
TGTGTGTTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.1023541453428864No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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