FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008151336

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008151336
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences750
Total Bases108.7 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length144-145
%GC48

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC24132.13333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC14919.866666666666667No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTAAGACGTGTAGAACCATG13117.466666666666665No Hit
AAATACCGTTCAGAACTGCCTTGTTTTTAAGTAAGACGTGTAGAACCATG496.533333333333332No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATAC324.266666666666667No Hit
AAATACCGTTCAGCACTGCCTTGTTTTTAAGTAAGACGTGTAGAACCATG91.2No Hit
AATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT81.0666666666666667No Hit
AAATACCGTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT60.8No Hit
AAATACGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT40.5333333333333333No Hit
AATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT40.5333333333333333No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAATTAAATAC40.5333333333333333No Hit
AAATACCGTTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTAAGACGTGTAGAACCAT30.4No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTAAGTAAGACGTGTAGAACCATGT30.4No Hit
AAATACCGTTCAAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT30.4No Hit
AAATACCGTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT20.26666666666666666No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGACCC20.26666666666666666No Hit
AAATACCGTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTAAGACGTGTAGAACCATGT20.26666666666666666No Hit
GGCACTAAATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATACA20.26666666666666666No Hit
AAATACCGTTCAGACTGCCTTGTTTTTAAGTAAGACGTGTAGAACCATGT20.26666666666666666No Hit
AAATACCGTTCAGGCTGCCTTGTTTTTAAGTAAGACGTGTAGAACCATGT20.26666666666666666No Hit
AATACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTAAGACGTGTAGAACCATGT20.26666666666666666No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCGTTGATACCACTGCTTCCATGTACTCTGC20.26666666666666666Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (95% over 22bp)
AAATACCGTTCAGAGCTGCCAGCTTGGGGTACCTGGGAGGGCATAGCACT20.26666666666666666No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCAGCTTGGGGTACCTGGGAGGGCACAGCACT20.26666666666666666No Hit
AAATACCGTTCGGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCTG20.26666666666666666No Hit
AAATACCGTTCAGAGTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.13333333333333333No Hit
AAAACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTAAGACGTGTAGAACCATGT10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCGAGCTGCCACCAGGAGCATGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.13333333333333333No Hit
AAATAACGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTAGCAAATTGATGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCAGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAAC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCAGCCACCAAGAGATTCCAAGTAGCTCCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCTGTTTTTAAGTAAGACGTGTAGAACCATGT10.13333333333333333No Hit
AAATAGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCTG10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGTAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACA10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCTCCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTACGCCAAGCAAACTGGCCCCACAGAAACACA10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCCTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAATAAGACGTGTAGAACCATGT10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGAAACC10.13333333333333333No Hit
GGCACTGAATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATACA10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.13333333333333333No Hit
AAAACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.13333333333333333No Hit
AATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGATGGAACCT10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGATGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCGAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
GGCACTAGAATGGACTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATACA10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAA10.13333333333333333No Hit
GGCACTAGATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATACA10.13333333333333333No Hit
AAATACGTAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTAAGACGTGTAGAACCATGTCG10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGTAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTCGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTTAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTTCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACAAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTAAGACGTGTAGAGCCAGG10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGATCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATCCCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTAAGACGTGTAGAACCATG10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAACTGCCTTGTTTTTAAGTAAGACGTGCAGAACCATG10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.13333333333333333No Hit
GGCACTAGAAGGACCTCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAATTAAATACA10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTCAGAGCCGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTAGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTACCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGCGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAAAC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACA10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGTTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGATCAGAGCTGCCACCAGGAGATTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATCCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCCCCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCCCCAAGAGCTTGCAAATTGCCGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAAC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGACACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATCGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.13333333333333333No Hit
AAACACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTACAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAAAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAGTTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAGCC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCATAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTTGAACC10.13333333333333333No Hit
AATACCGTTCAGAGCTGGCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.13333333333333333No Hit
AAATCCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTAAGACGTGTAGAACCATGT10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.13333333333333333No Hit
GGCACAAGAATGGACCTCTTCCACATCACTACATTATTTCAATTAAATAC10.13333333333333333No Hit
AATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCCGGAACCT10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCCGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCAGATGAAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.13333333333333333No Hit
AAATACCTTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACAAATAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCAACCAAGAGCTTTCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AATACCGTTCAGAACTGCCTTGTTTTTAAGTAAGACGTGTAGAACCATGT10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCCGCCTTGTTTTTAAGTAAGACGTGTAGAACCATG10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCAGCCACCAGGAGATTGAAAATTGCGGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGGGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAACTGCCTTGTTTTTAAGTAAGACGTGTAGAATCATG10.13333333333333333No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCAACAAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.13333333333333333No Hit
AAATCCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGATGGAACCT10.13333333333333333No Hit
AATACCTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTAAGACGTGTAGAACCATGTC10.13333333333333333No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph