FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008151355

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008151355
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences738
Total Bases106.9 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length143-145
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC24032.52032520325203No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG13918.834688346883468No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10814.634146341463413No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT8411.38211382113821No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC486.504065040650407No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG162.168021680216802No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC91.2195121951219512No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT60.8130081300813009No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT30.40650406504065045No Hit
TGTGTGTGCGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG30.40650406504065045No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAGG20.27100271002710025No Hit
CTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT20.27100271002710025No Hit
ACTTAAAAACAAGGCGGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC20.27100271002710025No Hit
ACTTAAAAACAAGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT20.27100271002710025No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT20.27100271002710025No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCCC20.27100271002710025No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC20.27100271002710025No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGCGCTACAGTTTCTGCCTC10.13550135501355012No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGTCCATTCTAGTGCCTTCGTGAGACCAAGTCT10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.13550135501355012No Hit
ACCAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCTTCCGTG10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGTTACAGTTTCTGCCTC10.13550135501355012No Hit
TCTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAACGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATAGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACACTTTCTGCCTC10.13550135501355012No Hit
ACCTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.13550135501355012No Hit
ACTTGAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGTCAG10.13550135501355012No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCCTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAACCAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGACTC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTTATGCCTAACGGGGTCCACATGCTGCCAC10.13550135501355012No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGATTTGGACAGAAGGGTAAAG10.13550135501355012No Hit
ACATAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACGGTTTCTGCCT10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGGTATCAACGCAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT10.13550135501355012Clontech Universal Primer Mix Long (95% over 22bp)
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATATTTCGTGAGACCAAGTCTC10.13550135501355012No Hit
ATTAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCTG10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTTTGCCTC10.13550135501355012No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTGTGGACAGAAGGGTAAAG10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTATGCCT10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGCTATTTTTCGTGAGACCAAGACTC10.13550135501355012No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAA10.13550135501355012No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATACCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTCATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGATACAGTTTCTGCCTC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGGGACCAAGTCTC10.13550135501355012No Hit
TGTGTTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.13550135501355012No Hit
CTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTTCAGTTTCTGCCTC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTTCTGACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCTG10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGTTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAAAGCTAATGGTGCTACAGTTACTGCCTC10.13550135501355012No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.13550135501355012No Hit
TGTGTGTGTGTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCCGCCTC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGGATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT10.13550135501355012Clontech Universal Primer Mix Long (95% over 22bp)
ACTTAAAACCAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCCAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTATGCCTC10.13550135501355012No Hit
TGTGTGTGTGTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAGGGGTAAAGC10.13550135501355012No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTGATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGCCCAAGTCTC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGACTC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCGGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAGTGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.13550135501355012No Hit
TGTGTGTGGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAA10.13550135501355012No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGTAGGGTAAAG10.13550135501355012No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTGGGACAGAAGGGTAAAG10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGTTATTTTTCTTGAGTATAAGACTC10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCTG10.13550135501355012No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTATAGTTTCTGCCT10.13550135501355012No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTCCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.13550135501355012No Hit
TGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGCT10.13550135501355012No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.12.1)