FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008151383

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008151383
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences951
Total Bases137.8 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length144-145
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG38440.37854889589905No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT15416.19348054679285No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC11512.092534174553101No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC858.937960042060988No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC596.203995793901157No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG171.7875920084121977No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC121.2618296529968454No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT50.5257623554153523No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC40.4206098843322818No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT40.4206098843322818No Hit
ACTTAAAAACAAGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC30.31545741324921134No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGTTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC30.31545741324921134No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT30.31545741324921134No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC30.31545741324921134No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCCTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG30.31545741324921134No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAGG20.2103049421661409No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTCGTGAGACCAAGTCTCT20.2103049421661409No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGCTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG20.2103049421661409No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAGAG20.2103049421661409No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT20.2103049421661409No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCCGCCT20.2103049421661409No Hit
ACTTAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCTG20.2103049421661409No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC20.2103049421661409No Hit
TGTGTGGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC20.2103049421661409No Hit
TGTGGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC20.2103049421661409No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAGGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG20.2103049421661409No Hit
TGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGCT20.2103049421661409No Hit
GTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC20.2103049421661409No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGCGCTACAGTTTCTGCCTC10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAATAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCAC10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGGCTC10.10515247108307045No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCATTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10515247108307045No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACTGAAGGGTAAGG10.10515247108307045No Hit
TTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTCTGACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCTG10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGCTTCTGCCT10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAATCAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10515247108307045No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGATAAAG10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTATGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAACTCTC10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGTCT10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCCCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10515247108307045No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGGAGGGTAAAG10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGGGCTACAGTTTCTGCCTC10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGTTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGATAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10515247108307045No Hit
ACTTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAACAAGGCCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10515247108307045No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACGGAAGGGTAAAG10.10515247108307045No Hit
TGTGAGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTAGTTAGACCAAGTCTCT10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAAAGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10515247108307045No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAA10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGAAGCAGTGGTA10.10515247108307045Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (100% over 25bp)
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAATG10.10515247108307045No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGCT10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10515247108307045No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGCTTCGTGAGACCAAGTCTCTGCTACCGTATT10.10515247108307045No Hit
TGTGTGTTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.10515247108307045No Hit
CTTAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCTG10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCCGGTACCCCAAGCTGGCAG10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.10515247108307045No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTGAAG10.10515247108307045No Hit
ATTAAAAATAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTAAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.10515247108307045No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATACTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.10515247108307045No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTCAGGAATCCAGGCGTGACTCAGCTGGGTT10.10515247108307045No Hit
ATTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10515247108307045No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGTACAGAAGGGTAAAG10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCGGCCT10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10515247108307045No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTCGGACAGAAGGGTAAAG10.10515247108307045No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10515247108307045No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAGACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10515247108307045No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTTGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTACCTC10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGATTCTGCCT10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10515247108307045No Hit
TGTGTGTATGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10515247108307045No Hit
ATAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTCTCTGCCTCT10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10515247108307045No Hit
ATTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10515247108307045No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCATAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCCGCCTC10.10515247108307045No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAGGGGTAAAG10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAACTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCT10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTTTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCATTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10515247108307045No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10515247108307045No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGTGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10515247108307045No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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