FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008151459

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008151459
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences865
Total Bases125.4 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length144-145
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG20423.583815028901732No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC18721.61849710982659No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT18221.040462427745666No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC12714.682080924855493No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC445.086705202312139No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC80.9248554913294799No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG60.6936416184971098No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT40.46242774566473993No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC40.46242774566473993No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTCGTGAGACCAAGTCTCT30.3468208092485549No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC30.3468208092485549No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC30.3468208092485549No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT30.3468208092485549No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTCGTGAGACCAAGTCTCT30.3468208092485549No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT20.23121387283236997No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGATTTGGACAGAAGGGTAAAG20.23121387283236997No Hit
ACTTAAAAACAAGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC20.23121387283236997No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC20.23121387283236997No Hit
GTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC20.23121387283236997No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAGG10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTACCTCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.11560693641618498No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTCTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTGATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11560693641618498No Hit
CTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.11560693641618498No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAAGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCAGCCTC10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAAGGATAATGTTGATAAAGTTAATGCATA10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAAAGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCC10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTCTGCCTC10.11560693641618498No Hit
ATTTAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT10.11560693641618498No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGGTTGGACAGAAGGGTAAAG10.11560693641618498No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.11560693641618498No Hit
ACTGAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.11560693641618498No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCA10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATGTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.11560693641618498No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGAGTAAAG10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGTAATTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTACCTC10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGACTAATGGTGCAACAGTTTCTGCCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGGTATCAACGCAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT10.11560693641618498Clontech Universal Primer Mix Long (95% over 22bp)
ACTTAAAAACAAGGCGCTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAACAAGCCAGTGCTAAAGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCT10.11560693641618498No Hit
ATTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAGGAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCTTCCGTGG10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGGTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT10.11560693641618498No Hit
AGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCACTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.11560693641618498No Hit
CTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGACTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGAGCAGTGGTAT10.11560693641618498Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (100% over 25bp)
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGTCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGTTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.11560693641618498No Hit
ATTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTGCCCCAAGCTGGCAG10.11560693641618498No Hit
ACTTAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCTG10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCC10.11560693641618498No Hit
TGTGTGTGTGTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAGGGGTAAAGC10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTGCAGTTTCTGCCT10.11560693641618498No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAGGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAATAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.11560693641618498No Hit
ATTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCGGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTTTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATAGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11560693641618498No Hit
ACTAAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGACT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTCTCTGCCTC10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCTGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.11560693641618498No Hit
TGCGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTTTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.11560693641618498No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAA10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACATGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTTGACGGTTTTTTCGTGAGACCAAGTCTCTGC10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACGGTTTCTGCCTC10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGCCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGAGAGAACAAGACAC10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTATAGTTTCTGCCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTCAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.11560693641618498No Hit
ACTTAATAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11560693641618498No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGCTGCTACAGTTTCTGCCTC10.11560693641618498No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph