FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008151461

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008151461
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences930
Total Bases134.8 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length144-145
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG33235.6989247311828No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC17819.13978494623656No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC12413.333333333333334No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT11712.580645161290322No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC384.086021505376344No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG111.1827956989247312No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT50.5376344086021506No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG40.43010752688172044No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT40.43010752688172044No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC40.43010752688172044No Hit
TGTGTTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC30.3225806451612903No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAAGTTTGGACAGAAGGGTAAAG30.3225806451612903No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT30.3225806451612903No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT30.3225806451612903No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGTTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC30.3225806451612903No Hit
TGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGCT30.3225806451612903No Hit
GTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC30.3225806451612903No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAGG20.21505376344086022No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAACGCCTAATGGTGCTGCAGTTTCTGCCT20.21505376344086022No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTCGTGAGACCAAGTCTCT20.21505376344086022No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACGGAAGGGTAAAG20.21505376344086022No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC20.21505376344086022No Hit
TGTGTGTGTGTTTTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC20.21505376344086022No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTAGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG20.21505376344086022No Hit
TGTGTGTGTGTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC20.21505376344086022No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAGGGGTAAAG20.21505376344086022No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT20.21505376344086022No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAACGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAAGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCATC10.10752688172043011No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCATTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTACTGCTAATGGTGCTACCGTTTCTGCCTC10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGCTTCTGCCTC10.10752688172043011No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTATCTATAAGGTTTCGACAGAAGGGTAAAG10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAATCAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10752688172043011No Hit
TGTGTGTGTGTTTCGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGGTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGATATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.10752688172043011No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGAGAGAAGGGTAAAG10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGACAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10752688172043011No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGGAGGGTAAAG10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGTTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTACTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10752688172043011No Hit
CTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCTT10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGAGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10752688172043011No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGATGGGTAAAG10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGAGAGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGCGCTACAGTTTCTGCCT10.10752688172043011No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGATAGAAGGGTAAAG10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCATGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGAGCTACAGTTTCTGCCTC10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAGTGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10752688172043011No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAA10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTCCCTC10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACATGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10752688172043011No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGTTAAAG10.10752688172043011No Hit
TGTGTGTTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.10752688172043011No Hit
CCTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.10752688172043011No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTGAAG10.10752688172043011No Hit
TGTGTGTGAGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10752688172043011No Hit
AATTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCATGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGTCTCT10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCCACAGTTTCTGCCT10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10752688172043011No Hit
TGTGTGTGTGGTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGAGTGCTATCAACGAAGAGGTCCATCTAGTGCCTTCG10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGAAGTGCTAATGCCTAATGGCGCTACAGTTTCTGCCT10.10752688172043011No Hit
ACTTGAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10752688172043011No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGCAAAG10.10752688172043011No Hit
TGTTTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCTTGAGACCAAGTCTC10.10752688172043011No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTACCTC10.10752688172043011No Hit
TGTGTGGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.10752688172043011No Hit
ACTTAAACAAGGCAGTTCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCTT10.10752688172043011No Hit
CTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCACT10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.10752688172043011No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGATTGGACAGAAGGGTAAAG10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCTGAAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.10752688172043011No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGGCAGAAGGGTAAAG10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT10.10752688172043011Clontech Universal Primer Mix Long (95% over 22bp)
TGGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCT10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAATAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.10752688172043011No Hit
ATTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTTTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTCTCTGCCTC10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAGC10.10752688172043011No Hit
TGCGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10752688172043011No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGGGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10752688172043011No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGTCTC10.10752688172043011No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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