FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008151491

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008151491
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences997
Total Bases144.5 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length144-145
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG39139.217652958876634No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC25025.075225677031092No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC14014.042126379137413No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC424.212637913741224No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT404.012036108324975No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC101.0030090270812437No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG80.802407221664995No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT60.6018054162487462No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT50.5015045135406219No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTCGTGAGACCAAGTCTCT30.3009027081243731No Hit
TGTGTGTGGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC30.3009027081243731No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT30.3009027081243731No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT20.20060180541624875No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGATCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC20.20060180541624875No Hit
TTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC20.20060180541624875No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTACCTC20.20060180541624875No Hit
TGTTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC20.20060180541624875No Hit
ACTTAAAAACAAGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT20.20060180541624875No Hit
TGTGTGTGTGTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC20.20060180541624875No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAGGGGTAAAG20.20060180541624875No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATACCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT20.20060180541624875No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGCCCAAGTCTC20.20060180541624875No Hit
ATTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT20.20060180541624875No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTGCAGTTTCTGCCTC20.20060180541624875No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT20.20060180541624875No Hit
TGTGTGTGTATTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10030090270812438No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAGG10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCATGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGCCCAAGTCTC10.10030090270812438No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGTTTCTTTAAGGTTTGGAAAGAAGGGTAAAGC10.10030090270812438No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGTGTAAAG10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAACTCAA10.10030090270812438No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTTGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10030090270812438No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGAGTAAAG10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCACTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10030090270812438No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGCTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10030090270812438No Hit
TGTGTGGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCGGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10030090270812438No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10030090270812438No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGATAAAG10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGTCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCT10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAGCGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.10030090270812438No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAGAG10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCACACTGACGACATGGTTCTACACGTCTTAC10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGACTC10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCTCAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAACAAGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGGTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT10.10030090270812438No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAA10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGTACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCACTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCCAAGTCT10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTTATGGTGCTACAGTTTATGCCGC10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGATAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10030090270812438No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGAGAGAAGGGTAAAG10.10030090270812438No Hit
TGTGTGTGTGTTTTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGCTCTGAACGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCTG10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTCTTCGTGAGACCAAGTCTC10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGTTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGTTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10030090270812438No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGAAAGAAGGGTAAAG10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCGAACGGTTTTTTCGTGAGACCAAGTCTCTG10.10030090270812438No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCATAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10030090270812438No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGAGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCCC10.10030090270812438No Hit
TGTGTGTGTGTTCCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAACGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10030090270812438No Hit
AAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCTTC10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAACGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGCAGTGCTATCAACGCAGAGGTCCATTCTAGTGCCTTC10.10030090270812438Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (95% over 22bp)
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCCAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGCGCTACAGTTTCTGCCT10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAGC10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10030090270812438No Hit
TGCGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10030090270812438No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTATCTGCCTCT10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCTTGAGCCCAATGCTC10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCTG10.10030090270812438No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGGGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10030090270812438No Hit
TGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGCT10.10030090270812438No Hit
GTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.10030090270812438No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTAACGGTAATTTTAGTGAGACCAAGTCTCT10.10030090270812438No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGTGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.10030090270812438No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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