FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008151531

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008151531
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences776
Total Bases112.5 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length142-145
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG19725.386597938144327No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC18423.711340206185564No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT13817.783505154639176No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10313.27319587628866No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC334.252577319587629No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC101.2886597938144329No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT50.6443298969072164No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAAAAGGGTAAAG40.5154639175257731No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT30.3865979381443299No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCCACAGTTTCTGCCTC30.3865979381443299No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT30.3865979381443299No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG30.3865979381443299No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG30.3865979381443299No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGCGCTACAGTTTCTGCCTC20.25773195876288657No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTCGTGAGACCAAGTCTCT20.25773195876288657No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT20.25773195876288657No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT20.25773195876288657No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT20.25773195876288657No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTACCTC20.25773195876288657No Hit
ACTTAAAAACAAGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC20.25773195876288657No Hit
TGTGTGTGTGTTTTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC20.25773195876288657No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCCGCCTC20.25773195876288657No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAA20.25773195876288657No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT20.25773195876288657No Hit
GTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC20.25773195876288657No Hit
TGTGTGTGTATTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACCGTATGTTTCTTGAGACAAAGACTC10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTGATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.12886597938144329No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAGG10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATCAACGAAGAGGTCCATTCTGTGCCTTC10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGTTACAGTTTCTGCCTC10.12886597938144329No Hit
ACAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCTT10.12886597938144329No Hit
CTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.12886597938144329No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCAGCCTC10.12886597938144329No Hit
CTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAAGCAGTGGTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT10.12886597938144329Clontech Universal Primer Mix Long (95% over 22bp)
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCGGCCT10.12886597938144329No Hit
CGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACGGTTTCTGCCT10.12886597938144329No Hit
TGTGTGGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAAGCAGTGGTATCAACGGAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT10.12886597938144329Clontech Universal Primer Mix Long (95% over 22bp)
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTGGGTGGGAAGAGGTCCATTCTAGTGCC10.12886597938144329No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAACGGTAAAG10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAATTTCTGCCTC10.12886597938144329No Hit
TTTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCTGCGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCTGC10.12886597938144329No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGTTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCTGAAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.12886597938144329No Hit
TGTGTTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGATAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.12886597938144329No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGGAGGGTAAAG10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGTCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGTTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.12886597938144329No Hit
ACTTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.12886597938144329No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGGCAGAAGGGTAAAG10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACGAAGTCTC10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGTAGCTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTC10.12886597938144329No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAGGGGTAAAG10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATACCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.12886597938144329No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCGTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.12886597938144329No Hit
ACTTAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCTG10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCT10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAATAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAGC10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCTG10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTGCAGTTTCTGCCTC10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCGGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACGAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAGTGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGACT10.12886597938144329No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTCTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAGC10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCAACAGTTTCTGCCTC10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAACGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCCTGAACGGTATTTTTCGTGAGACCAAGTCTCT10.12886597938144329No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTCCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.12886597938144329No Hit
TGTGTGTTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.12886597938144329No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGTCTC10.12886597938144329No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.12.1)