FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008151679

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008151679
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences8175
Total Bases1.1 Mbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140-145
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT607174.26299694189602No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTCCTCTAAGACCAAGTCTC4865.944954128440367No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC1692.0672782874617734No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTCCTCTAAGACCAAGTCTC1091.3333333333333335No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG841.0275229357798166No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC680.8318042813455658No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG570.6972477064220184No Hit
CTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC490.599388379204893No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTCCTCTAAGACCAAGTCTC430.5259938837920489No Hit
ACTTAAAAACAAGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC370.4525993883792049No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC340.4159021406727829No Hit
ATTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC290.3547400611620795No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC280.3425076452599389No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCCC230.28134556574923547No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCCGCCT230.28134556574923547No Hit
ACTTAAAAACAAGGAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC220.2691131498470948No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGCGCTACAGTTTCTGCCT210.25688073394495414No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCC170.20795107033639146No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTCTCTGCCT160.19571865443425077No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTCCTCTAAGACCAAGTCTCT160.19571865443425077No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTACCT160.19571865443425077No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGTTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT140.17125382262996944No Hit
ACTTAAAAACAAGGCGGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT140.17125382262996944No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTGCAGTTTCTGCCT140.17125382262996944No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCCACAGTTTCTGCCT130.15902140672782875No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAGTGGTGCTACAGTTTCTGCCT130.15902140672782875No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAACGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT120.14678899082568808No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGTCT120.14678899082568808No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGTCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT120.14678899082568808No Hit
ACTTAAAAACAAGGCGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC110.1345565749235474No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCCAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT100.12232415902140673No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGTTACAGTTTCTGCCT90.11009174311926606No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGACTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT90.11009174311926606No Hit
ACTTAAAAACAAGGCATGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC90.11009174311926606No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAATTTCTGCCT90.11009174311926606No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTACTACAGTTTCTGCCT90.11009174311926606No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCCAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT90.11009174311926606No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAACGGTGCTACAGTTTCTGCCT90.11009174311926606No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

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