FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008151779

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008151779
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences5175
Total Bases750 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length141-145
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC383874.16425120772946No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTCCTCTAAGACCAAGTCTC2855.507246376811594No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT881.7004830917874396No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTCCTCTAAGACCAAGTCTC591.1400966183574879No Hit
CTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT521.0048309178743962No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTCCTCTAAGACCAAGTCTC490.9468599033816425No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT350.6763285024154589No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT240.463768115942029No Hit
ACTTAAAAACAAGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT220.4251207729468599No Hit
ATTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT210.4057971014492754No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTCAGGAATCCAGGCGTGACTCAGCTGGGTT180.34782608695652173No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT160.30917874396135264No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCCGCCTC140.2705314009661836No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCCC130.25120772946859904No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGCGCTACAGTTTCTGCCTC120.2318840579710145No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGTTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC120.2318840579710145No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGCTTCTGCCTC110.21256038647342995No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGTTACAGTTTCTGCCTC110.21256038647342995No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCCACAGTTTCTGCCTC110.21256038647342995No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTCCTGCCTC110.21256038647342995No Hit
ACTTAAAAACAAGGAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT100.1932367149758454No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTGCAGTTTCTGCCTC100.1932367149758454No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG90.17391304347826086No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTCTCTGCCTC90.17391304347826086No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGCAGCTCTGAACGGTATTTCCTCTAAGACCAA90.17391304347826086No Hit
ACTTAAAAACAAGGCGGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC80.15458937198067632No Hit
ACTTAAAACAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCTT80.15458937198067632No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGTCTC80.15458937198067632No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGATAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC80.15458937198067632No Hit
ACTTAAAAACAAGGCATGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT70.1352657004830918No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTCCTCTAAGACCAAGTCTCT70.1352657004830918No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTACCTC70.1352657004830918No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTGATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC70.1352657004830918No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG70.1352657004830918No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGATAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC60.11594202898550725No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC60.11594202898550725No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGGGACAAAGGTGGGGTTCTAGGGGGCTTGGG60.11594202898550725No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

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