FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008151833

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008151833
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences6457
Total Bases935.9 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length142-145
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC377358.43270868824531No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT89513.86092612668422No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTCCTCTAAGACCAAGTCTC3865.978008363016881No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG1291.9978318104382842No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT1071.6571163078829179No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTCCTCTAAGACCAAGTCTC941.4557844200092922No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG781.207991327241753No Hit
CTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT460.7124051417066749No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTCCTCTAAGACCAAGTCTC400.6194827319188477No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCCC360.557534458726963No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG280.43363791234319343No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC240.37168963915130865No Hit
ACTTAAAAACAAGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT240.37168963915130865No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT220.34071550255536626No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCCC170.2632801610655103No Hit
ACTTAAAAACAAGGAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT160.2477930927675391No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT150.2323060244695679No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT130.20133188787362552No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGTTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC120.18584481957565432No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTACTACAGTTTCTGCCTC120.18584481957565432No Hit
ATTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT110.17035775127768313No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGATAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC100.15487068297971193No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAACGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC90.13938361468174074No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCCACAGTTTCTGCCTC90.13938361468174074No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTCCTCTAAGACCAAGTCTCT80.12389654638376955No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTCTCTGCCTC80.12389654638376955No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAGTGGTGCTACAGTTTCTGCCTC80.12389654638376955No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGACTC80.12389654638376955No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGTCTC70.10840947808579836No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAACGGTGCTACAGTTTCTGCCTC70.10840947808579836No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTCCTGCCTC70.10840947808579836No Hit
ACTTAAAAACAAGGCGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT70.10840947808579836No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC70.10840947808579836No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.12.1)