FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008152615

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008152615
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences6760
Total Bases979.9 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length143-145
%GC47

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC222832.9585798816568No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC131019.37869822485207No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG130519.30473372781065No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC3905.769230769230769No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT2754.068047337278107No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC1011.4940828402366864No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT670.9911242603550295No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG520.7692307692307693No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG370.5473372781065089No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT300.4437869822485207No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTGGACAGACCAAGTCTCT300.4437869822485207No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT250.3698224852071006No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT240.35502958579881655No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT150.22189349112426035No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC120.17751479289940827No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT120.17751479289940827No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT120.17751479289940827No Hit
CTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT110.16272189349112426No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTGGACAGACCAAGTCTCT100.14792899408284024No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT100.14792899408284024No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAACGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC90.1331360946745562No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTCTCTGCCTC90.1331360946745562No Hit
CCTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC90.1331360946745562No Hit
ACTTAAAAACAAGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT90.1331360946745562No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT90.1331360946745562No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGTTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC80.1183431952662722No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCCGCCTC80.1183431952662722No Hit
TCTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC80.1183431952662722No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC80.1183431952662722No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGCTTCTGCCTC70.10355029585798817No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT70.10355029585798817No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCCACAGTTTCTGCCTC70.10355029585798817No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAGGGGTAAAG70.10355029585798817No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT70.10355029585798817No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT70.10355029585798817No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC70.10355029585798817No Hit
ACTTAAAAACAAGGAGTGCTAATGCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT70.10355029585798817No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCTAATGGTGCTGCAGTTTCTGCCTC70.10355029585798817No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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