FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008152987

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008152987
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences847
Total Bases122.8 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length143-145
%GC46

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT33139.07910271546635No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG17921.133412042502954No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC16819.834710743801654No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC435.076741440377805No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC111.2987012987012987No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC111.2987012987012987No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG60.7083825265643447No Hit
ACTTAAAAACAAGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC30.3541912632821724No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT30.3541912632821724No Hit
ATTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC30.3541912632821724No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG30.3541912632821724No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT20.23612750885478156No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC20.23612750885478156No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCCACAGTTTCTGCCT20.23612750885478156No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT20.23612750885478156No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT20.23612750885478156No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT20.23612750885478156No Hit
TGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGCT20.23612750885478156No Hit
TGTGTGTGTATTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTATTGGGGGTCCTGTTGTTGCGG10.11806375442739078No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTGAAG10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTGGACAGCCCAAGTCTC10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGACCGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC10.11806375442739078No Hit
AATTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11806375442739078No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGACAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC10.11806375442739078No Hit
AGTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAAGCAGTGGTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT10.11806375442739078Clontech Universal Primer Mix Long (95% over 22bp)
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTCTCTGCCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAAACCCTAATGGTGCTACAGTAACAGCCT10.11806375442739078No Hit
ACGTAAAAACAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT10.11806375442739078No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTCGGACAGAAGGGTAAAG10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATTGCCTAATGGTGCTACGGTTTCTGCCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGACTAATGGTGCTACAGTTTCTTCCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGTGCTAACGCCTAATGGCGCTACAGTTTCTGCCTC10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTCGCAG10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCGGTGCTAATGCATAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11806375442739078No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACAAAGTCTC10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGATACAGTTTCTGCCT10.11806375442739078No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGCAAAG10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTAATTTTGGACAGACCAAGTCTC10.11806375442739078No Hit
TGTGTGCGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.11806375442739078No Hit
ACATAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCAT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTGGACAGACCAAGTCTCTG10.11806375442739078No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGCTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGCTTCTGCCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACTGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACACTTTCTGCCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTACCGTAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTG10.11806375442739078No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAAGGTAAAG10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTCCTAATGCCTAATGGTCCTACAGTTTATGCCT10.11806375442739078No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTGTGTGTGTGGCAGCTCTGAACGGTATTTT10.11806375442739078No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAGAG10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGGTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAGTGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGCCCAAGTCTC10.11806375442739078No Hit
TGTGTGTGTGTTTTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAACAACAGTGCTAATGCCTAGTGGTGCTACAGTTTCTGCCTCTT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGTTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGTCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTACCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGGCTC10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCATAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11806375442739078No Hit
TGTGTGTGTGTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.11806375442739078No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGGCAGAAGGGTAAAG10.11806375442739078No Hit
ACTTAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAAAGGAAATTTTGGACAGACCAAGTCTC10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCAGAAAGCTATTTTGGACAGACCAAGTCTCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCC10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAACGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11806375442739078No Hit
ATTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATCGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAATAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGCGCTACAGTTTCTGCCT10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCGGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.11806375442739078No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTCTGGACAGAAGGGTAAAG10.11806375442739078No Hit
ACATAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGATCGGTATTTTTGGACAGCCCAAGTCTC10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATGCCTGAAGTGGTCACTCTGTGGCCCGC10.11806375442739078No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTCCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.11806375442739078No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTACGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG10.11806375442739078No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC10.11806375442739078No Hit
ACTTAAAAACAAGGCACTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT10.11806375442739078No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph