FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008153036

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008153036
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences981
Total Bases142.1 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length143-145
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC16917.227319062181447No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATG16116.411824668705403No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATAC12913.149847094801222No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC11511.722731906218145No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAATTAAATAC11111.314984709480122No Hit
AAATACCGTTCAGAACTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATG596.014271151885831No Hit
AAATACCGTTCAGCACTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATG111.1213047910295617No Hit
AATACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATGT101.019367991845056No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCAGCTTGGGGTACCTGGGAGGGCACAGCACT90.9174311926605505No Hit
GGCACTAGATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATACA60.6116207951070336No Hit
AATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT50.509683995922528No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATGT40.40774719673802245No Hit
AAATACCGTTCAGAGTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT30.3058103975535168No Hit
AAATACCGTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATGT30.3058103975535168No Hit
GGCATAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATACA30.3058103975535168No Hit
GGCACTAAATGGACCTCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAATTAAATACA30.3058103975535168No Hit
GCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATACA30.3058103975535168No Hit
GGCATAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAATTAAATACA30.3058103975535168No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAGCC30.3058103975535168No Hit
AATACCGTTCAGAACTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATGT30.3058103975535168No Hit
AAATACCGTTCGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATGT20.20387359836901123No Hit
AAATACCGTTCAGACTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATGT20.20387359836901123No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCCTGCAAATTGCTGCTGGAACC20.20387359836901123No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGAAACC20.20387359836901123No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGTAAATTGCTGCTGGAACC20.20387359836901123No Hit
GGCACTAGAAGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATACA20.20387359836901123No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCGTTGATAGCACTGCCTTGTTTTTAAGTGG20.20387359836901123No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTCGCAAATTGCTGCTGGAACC20.20387359836901123No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAATTAAATGC20.20387359836901123No Hit
AAATACCGTTCAGAACTGCCTTGTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATGT20.20387359836901123No Hit
GGCCTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATACA20.20387359836901123No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGAAAATTGCTGCTGGAACC20.20387359836901123No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCAGCTTGGGGTACCTGGGAGGGCATAGCACT20.20387359836901123No Hit
AAATACCGTCAGAACTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATGT20.20387359836901123No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCAGCTGGAACC20.20387359836901123No Hit
GGCCTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAATTAAATACA10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTAAGAACTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGCACCATG10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATGT10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCCCCAGGAGCTTGCAAATTGCTTCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
GCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAATTAAATACA10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATAGCTGATGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAACTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGGAGAACCATG10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCGGCACTAGAATGGACCTCTGCGTTGATAC10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATCTCAATTAAATAC10.10193679918450561No Hit
AATACCGTTCAGAGCTGCCACAAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGATTGCAAATTGATGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAATGGCTAATGTAGAACCATGT10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAGCCATG10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGATCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATAC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCGAACTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATGT10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGTACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGCGCTGCCACCAGGAGCTAGCAAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
GCACTAGATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATACAA10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTGGATAATGTAGAACCATG10.10193679918450561No Hit
AATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAAACT10.10193679918450561No Hit
GGCACTGAATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATACA10.10193679918450561No Hit
AAAACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCAACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAAATAAATAC10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATAACTAAATTATTTCAATTAAATAC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGATGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGCACC10.10193679918450561No Hit
AAATAACGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGCACCCTG10.10193679918450561No Hit
GGCACTAAATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATACA10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGCAACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAGATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCAACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
GGACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATACA10.10193679918450561No Hit
AAATAACGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTTCTGCTTGAACC10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATACT10.10193679918450561No Hit
GCACTAGAATGGACCTCGTCCTCATCACTAAATTATTTCAAGTAAATACA10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCAATAAATAATTTCAATTAAATAC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCATGCAAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCGTTGATACCACTGCTTACCCACAGAAACA10.10193679918450561Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (95% over 22bp)
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGAAAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACAAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTAAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGAAAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAACTAC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGCACTGCCTTGTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATGT10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGATCTCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAATTAAATAC10.10193679918450561No Hit
GAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGAAAATTGCTGCTGGGACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCATGTATTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATG10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCATCCTCATCACTACATTATTTCAAATAAATAC10.10193679918450561No Hit
AAAAACCGTTCAGAGCTGACACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTACTTCAATTAAATAC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATACA10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCTCTAAATTATTTCAATTAAATAC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCGGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAACTGCCTAGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATG10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCAGCCAACAAGAGCTTGCAAATTGCTGCAGGAACC10.10193679918450561No Hit
GGCCTAATGGACCTCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAATTAAATACAAT10.10193679918450561No Hit
AAAACGTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCTGA10.10193679918450561No Hit
GTCACTAAATGGACCTCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAATTAAATACA10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCGGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAGCC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGATCGCAAATTGCTGCTGTAACC10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGATGGACCTCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAATTAAATACA10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCTG10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAAAC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGTTGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCCGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAAGCTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATGT10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCCCATCACTACATTATTTCAATTAAATAC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAACTGCCTTGTTTTTAAGTGGATAATGTAGAACAATG10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCGAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGATCTTGCAAATTGATGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAATATCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATG10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATGT10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATAGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATAC10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTGAATAC10.10193679918450561No Hit
AAATACCATTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATG10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATC10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACAAAATTATTTCAATTAAATAC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGACACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTGCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCGTTGATACCACTGCTCCCAAGTACTCTGC10.10193679918450561Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (95% over 21bp)
GTCACAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATACA10.10193679918450561No Hit
GGCATAGAATGGACCTCTTCCTCATCACGACATTATTTCAATTAAATACA10.10193679918450561No Hit
AAATACCTTTCAGAGCTGACACCAGGAGCTTGCAAATTCCTGCTGGAAGC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCAGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCGCCAAGATCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATT10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGTTGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAACACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTGCGTTGATACCACTGCTTACCCACAGAAACA10.10193679918450561Clontech Universal Primer Mix Long (95% over 23bp)
AAATACCGTTCAGAGTTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCAGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCGTTGATACCACTGCTTCCATGTACTCTGC10.10193679918450561Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (95% over 22bp)
ACCTTAAAGAAACCCACAGAAACACACACACAGGCTAATGTAGAACCATG10.10193679918450561No Hit
AAACACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATG10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAGATACA10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTACAAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
GGCACTGAATGGACCTCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAATTAAATACA10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTACAGAGCTGCCTAGTATTTAAGAGGCTAATGAAGAACCAAG10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGACCC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATGT10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGCACCATG10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGCAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTAATTTATTTCAATTAAATAC10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAATTAAATAA10.10193679918450561No Hit
AATACCGTTCGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCTG10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCCTATCACTAAATTATTTCAATTAAATAC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAGGAGCTTGTAAATTGCTGTTGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAATACAGTTTAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
GGCACAAATGGACCTCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAATTAAATACAA10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGATCC10.10193679918450561No Hit
AATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCCCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAATTAAATAC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAGATTGCTGCTGGACCC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGATGCAACCAGGAGATTCCAAATTGCTGCAGGAACC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGGCTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.10193679918450561No Hit
AATACCGTTCAGAGCTGCCAGCTTGGGGTACCTGGGAGGGCACAGCACTG10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGGGCTAATGTAGAACCATGT10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCTCATCACTGCATTATTTCAATTAAATAC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCCACAGAAACACACACACAGGCTAATGTAGA10.10193679918450561No Hit
AAATACGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTTATGTAGAACCATG10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAAGCTGCCTTGTTTTTAAGCGGCTAATGTAGAACCATGT10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCCTAATCACTAAATTATTTCAATTAAATAC10.10193679918450561No Hit
AAATAACATTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAAGC10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAACTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACC10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGCCTCTTCCTCATCACTACATTATTTCAATTAAATACA10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAACTTCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACCATG10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGACTGCCACCAGGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGAACCT10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGCCTCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAATTAAATACA10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTAAGAGCTGCCTTGTTTTTAAGTGGCTAATGTAGAACAATT10.10193679918450561No Hit
AAATACCGTTCAGAGCTGCCACCAAGAGCTTGCAAATTGCTGCTGGGACC10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGACCTCTTCGTTGATACCACTGCTCCCATGTACTCTGC10.10193679918450561Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (95% over 21bp)
AAATACCGTTCAGAGCTGCCAGCTTGGTGTACCTGGGAGGGCACAGCACT10.10193679918450561No Hit
GGCACTAGAATGGGCCTCTTCCTCATCACTAAATTATTTCAATTAAATAC10.10193679918450561No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph