FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008153091

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008153091
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences942
Total Bases136.5 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length144-145
%GC48

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT45548.30148619957537No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC22523.88535031847134No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC606.369426751592357No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG262.7600849256900215No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC161.6985138004246285No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC161.6985138004246285No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGACTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT60.6369426751592357No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG40.42462845010615713No Hit
ATTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC40.42462845010615713No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT30.3184713375796179No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTTTTTTGGACAGACCAAGTCTCT30.3184713375796179No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT30.3184713375796179No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC30.3184713375796179No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTGGACAGACCAAGTCTCT30.3184713375796179No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAACGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT20.21231422505307856No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGATCGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC20.21231422505307856No Hit
CTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC20.21231422505307856No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGTTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT20.21231422505307856No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTGGACAGACCAAGTCTCT20.21231422505307856No Hit
CCTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT20.21231422505307856No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT20.21231422505307856No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT20.21231422505307856No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACGGTTTCTGCCT20.21231422505307856No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCCAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT20.21231422505307856No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT20.21231422505307856No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG20.21231422505307856No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT20.21231422505307856No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGTCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT20.21231422505307856No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCC20.21231422505307856No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTGCAGTTTCTGCCT20.21231422505307856No Hit
ACTTAAAAACAAGGCACTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT20.21231422505307856No Hit
ACTTAAAAACAAGCCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAAGCAGTGGTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT10.10615711252653928Clontech Universal Primer Mix Long (95% over 22bp)
ACTTAAAAACAAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGGTCCATTCTAGTGCTTG10.10615711252653928Clontech Universal Primer Mix Long (95% over 22bp)
ACTTAAAAACAAGGCGGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCAGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT10.10615711252653928No Hit
ACATAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTAACGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCTG10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACATGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGCTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGAGCTACAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTAAAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGAATAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGTCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAACCAGCTATTAACGGTAATAATGGACAGACCAAGTCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGGGCTACAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACCTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGAAGCAGTGGT10.10615711252653928Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (96% over 25bp)
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGATAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAATAACAAGGCAGTGCTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCATGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCTAGGTACCCCAAGCTGGCAG10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGAGCAGTGGT10.10615711252653928Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (100% over 25bp)
ACTTAAAAACAAGGCAGCTATGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAACTCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATTGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCCAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCCGCCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGACCTCCCAGGTAACCCAAGCTGGCAG10.10615711252653928No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT10.10615711252653928No Hit
CCTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTGGACAGACCAAGTCTCT10.10615711252653928No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATCAACGCAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGCATTTTTGGACAGACCAAGTCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTCTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGTTGCTACAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCCACAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAACAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCTG10.10615711252653928No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACATGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTACTACAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTATTGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAAAAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGAAGCTCTGAACGGAATTTTTGGACAGACAAACTCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCACT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAACAAGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGTACAGACCAAGTCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT10.10615711252653928No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTGTGCCTGTGTATGTCTGTGCCTGTGTGTG10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATCGACGAAGAGGTCCAGTCTAGTGCCTT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAACGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGCACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC10.10615711252653928No Hit
ACTAAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAATAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGCCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGCCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCAACAGATTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
CTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAGC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCACGCAG10.10615711252653928No Hit
TGTGATGCTGATGATGCTGATAATGCCAGTAAACTAGCTGCAATGCTAAA10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGTCTC10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTCCAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGGCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGTCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT10.10615711252653928No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAA10.10615711252653928No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCCGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCTG10.10615711252653928No Hit
ATTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC10.10615711252653928No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph