FastQCFastQC Report
Wed 10 Jul 2024
EGAF00008153099

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008153099
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences2920
Total Bases423.3 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length144-145
%GC47

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT111338.11643835616438No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG61921.198630136986303No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC55318.938356164383563No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC1595.445205479452055No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG331.13013698630137No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTC301.0273972602739725No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC270.9246575342465754No Hit
ACTTAAAAACAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC160.547945205479452No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTGGACAGACCAAGTCTCT160.547945205479452No Hit
ACTTAAAACAAGGCAGCTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT140.4794520547945206No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATGCCCTCCCAGGTACCCCAAGCTGGCAG80.273972602739726No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGTTACAGTTTCTGCCT70.2397260273972603No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTGAACGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT60.2054794520547945No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAGG50.17123287671232876No Hit
ACTTAAAAACAAGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC50.17123287671232876No Hit
CTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC50.17123287671232876No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGTTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT50.17123287671232876No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT50.17123287671232876No Hit
ACTTAAAAACAAGGCGGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT50.17123287671232876No Hit
ACTTAAAAAAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC50.17123287671232876No Hit
ACTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC50.17123287671232876No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGACTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT40.136986301369863No Hit
CCTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT40.136986301369863No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT40.136986301369863No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAGGGGTAAAG40.136986301369863No Hit
ATTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC40.136986301369863No Hit
TGTGTGTGTGTTCTGTGGGTTTCTTTAAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAGC40.136986301369863No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCAGCCT30.10273972602739725No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTTCTGAACGGTATTTTGGACAGACCAAGTCTCT30.10273972602739725No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTGATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCT30.10273972602739725No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGCTCTAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT30.10273972602739725No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTCTCTGCCT30.10273972602739725No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTATCAACGAAGAGGTCCATTCTAGTGCCTT30.10273972602739725No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTCTGAACGGTATTTTTGGACAGACCAAGTCTCT30.10273972602739725No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCCGCCT30.10273972602739725No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTTTGCCT30.10273972602739725No Hit
ACTTAAAAACAAGGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCC30.10273972602739725No Hit
ACTTAAAAACAAGGAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTC30.10273972602739725No Hit
ACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCA30.10273972602739725No Hit
TGTGTGTGTGTTTCTGTGGGTTTCTTTGAGGTTTGGACAGAAGGGTAAAG30.10273972602739725No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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