FastQCFastQC Report
Tue 7 May 2024
EGAF00008388895

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00008388895
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences1200
Total Bases181.1 kbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length149-151
%GC52

[WARN]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TACGGAGGATCCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGAGCGTA25221.0No Hit
AACGTAGGTCACAAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGTGTAAAGGGAGCGCA12510.416666666666668No Hit
TACGTATGGTGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGCA12310.25No Hit
TACGTAGGGGGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGTA1099.083333333333334No Hit
TACGTAGGGTGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGGGCTCGTA252.083333333333333No Hit
TACGGAGGATGCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGAGCGCA211.7500000000000002No Hit
TACGTAGGGAGCGAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGTGTAAAGGGAGCGTA211.7500000000000002No Hit
AACGTAGGGTGCAAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGTGTAAAGGGAGCGCA211.7500000000000002No Hit
TACGTATGGTGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGTA201.6666666666666667No Hit
TACGTAGGGGGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGCA131.0833333333333335No Hit
TACGTAGGGGGCGAGCGTTATCCGGATTCATTGGGCGTAAAGCGCGCGTA131.0833333333333335No Hit
TACGTAGGGGGCAAGCGTTATCCGGAATTACTGGGTGTAAAGGGTGCGTA110.9166666666666666No Hit
TACGTAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGTGCGCA110.9166666666666666No Hit
TACGGAGGATTCAAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGTGCGTA110.9166666666666666No Hit
AACGTAGGTCACAAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGTGTAAAGGGGGCGCA70.5833333333333334No Hit
TACGTATGGAGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGTGTA70.5833333333333334No Hit
TACGGAGGATCCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGTGCGTA60.5No Hit
TACGTAGGTGGCGAGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGAGCATGTA60.5No Hit
TACGTATGGTGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGGA60.5No Hit
TACGTAGGGGGCAAGCGTTATCCGGAATTACTGGGTGTAAAGGGAGCGTA60.5No Hit
TACGGAGGATCGGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGAGCGTA50.4166666666666667No Hit
TACGTAGGTGGCGAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGAGGGAGCA50.4166666666666667No Hit
TACGTATGGAGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGTGCGTA50.4166666666666667No Hit
TACGGAGGATGCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGTGCGTA50.4166666666666667No Hit
TACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGTGTAAAGGGAGCGTA40.33333333333333337No Hit
TACGGAGGATCCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGGGCGTA40.33333333333333337No Hit
TACGTAGGGAGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGCGCGCA40.33333333333333337No Hit
TACGGAGGATCCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGAGGGTA30.25No Hit
TACGGAGGATCCAAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGTGCGTA30.25No Hit
AACGTAGGTCACAAGCGTTGTCCGGAGTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGCA30.25No Hit
TACGTATGGGGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGTA30.25No Hit
TACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATCACTGGGCGTAAAGCGCACGTA30.25No Hit
TACGTAGGGAGCGAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGTGTAAAGGGAGCGCA30.25No Hit
AACGTAGGTCACAAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGGGTAAAGGGAGCGCA20.16666666666666669No Hit
TACGTAGGGGGCAAGCGTTATCCGAAATTACTGGGTGTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGTATGGTGCAAGCGTTATCTGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGCA20.16666666666666669No Hit
TACGGAGGCTCCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGTAGGGGGCGAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGGAGGATGCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGAGCGCT20.16666666666666669No Hit
AACGTAGGTCACAAGCGTTGTCCGGAATTAGTGGGTGTAAAGGGAGCGCA20.16666666666666669No Hit
TACGTATGGGGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGCA20.16666666666666669No Hit
TACGGAGGATGCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGTATGGTGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGGGCGCA20.16666666666666669No Hit
TACGTATGGGGCGAGCGTTATCCGGATTCATTGGGCGTAAAGCGCGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGTAGGGAGCGAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGCGTGTA20.16666666666666669No Hit
TACGTATGGAGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGTAGGGGGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGGGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGGAGGATCCGAGCGTTATCCGGGTTTATTGGGTTTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGGAGGATCCGAGCGTTATCCGGATTGATTGGGTTTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGTATGGTGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGGGCA20.16666666666666669No Hit
TACGGAGGATCCGAGCGTTATCTGGATTTATTGGGTTTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGTGTATAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TAGGGAGGATCCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGTAGGGGGCAAGCGTTATCCGGATTTAGTGGGTGTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGGAGGATCCGAGCGTTATCCGGATTTAGTGGGTTTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGGAGGATCTGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
ACGTAGGTCACAAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGTGTAAAGGGAGCGCAG20.16666666666666669No Hit
TACGGAGGATCCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGAGCGGA20.16666666666666669No Hit
TACGTAGGGTGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGCA20.16666666666666669No Hit
TACGTAGGGGGCTAGCGTTATCCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGTGCGTA20.16666666666666669No Hit
GACGTATGGAGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGTGCGTA20.16666666666666669No Hit
AACGTAGGTCACAAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGTGTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGTATGGTGCAAGCGTTATCGGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGCA20.16666666666666669No Hit
TACGGAGGATCCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGATTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGGAGGATCCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTCTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGTATGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGTGCGCA20.16666666666666669No Hit
TACGTAGGGTGCAAGCGTTAGTCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGTGCGCA20.16666666666666669No Hit
TACGTATGGTGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGGGTAAAGGGAGCGCA20.16666666666666669No Hit
TACGGAGGATTCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
AACGTAGGTCACAAGCGTTGTCGGGAATTACTGGGTGTAAAGGGAGCGCA20.16666666666666669No Hit
TACGTAGGTGGCGAGCGTTGTCCGGATTTACTGGGCGTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGTAGGTGGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGCGTGTA20.16666666666666669No Hit
TACGTATGGGGCAAGCGTTATGCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGGAGGATCCGAGCGTTATCCGGAGTTATTGGGTTTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGTATGGTGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGAGGGAGCA20.16666666666666669No Hit
TACGTAGGGAGCAAGCGTTGTCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGTGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGGAGGATCCAAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGAGCGTA20.16666666666666669No Hit
TACGGAGGATTCAAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGTGCGCA20.16666666666666669No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.12.1)